(1) Административното ръководство на Агенцията се осъществява от главен секретар.
(2) Главният секретар:
- 1. ръководи, координира и контролира функционирането и дейността на административните звена за точното спазване на нормативните актове и за изпълнението на законните разпореждания на изпълнителния директор;
- 2. отговаря за планирането и отчетността при изпълнението на ежегодните цели на Агенцията;
- 3. представлява Агенцията в случаите, когато изрично е упълномощен от изпълнителния директор;
- 4. организира разпределението на задачите за изпълнение между административните звена на Агенцията;
- 5. създава условия за нормална и ефективна работа на звената в Агенцията;
- 6. координира и контролира финансово-стопанската дейност на Агенцията;
- 7. координира и контролира дейността по управлението на държавната собственост, предоставена на Агенцията;
- 8. контролира и отговаря за работата с документите и за тяхното съхраняване;
- 9. утвърждава поименното разписание на Агенцията и длъжностните характеристики на служителите;
- 10. осъществява и други дейности, възложени му от изпълнителния директор.
(3) При отсъствие на главния секретар неговите функции се изпълняват от служител, определен за всеки конкретен случай с писмена заповед на изпълнителния директор.