Специализираната администрация на агенцията е организирана в 4 дирекции:
- 1. дирекция “Туристическа политика”;
- 2. дирекция “Развитие на туристическия продукт”;
- 3. дирекция “Регистриране и категоризиране”;
- 4. дирекция “Маркетинг, реклама и информация”.