(1)(Изм. и доп. - ДВ, бр. 33 от 2019 г., в сила от 19.04.2019 г.) Агенцията е структурирана в обща и специализирана администрация, служител по сигурността на информацията и финансов контрольор.
(2)(Изм. - ДВ, бр. 33 от 2019 г., в сила от 19.04.2019 г.) Структурните подразделения на административните звена по ал. 1 се определят с писмена заповед на директора на агенцията.