(1) Агенцията се ръководи и представлява от директор.
(2) Директорът на агенцията е едноличен орган на изпълнителната власт, който се назначава и освобождава съгласно разпоредбите на чл. 9 ал. 1 - 3 ЗДФИ.
(3) Директорът на агенцията:
- 1. ръководи, координира и контролира изпълнението на функциите на агенцията;
- 2. представлява агенцията в контактите и с други органи и организации, включително на международно ниво;
- 3. планира, разпределя и контролира използването на предоставените бюджетни средства на агенцията;
- 4. сключва договори, свързани с осъществяването на дейността на агенцията;
- 5. утвърждава длъжностното разписание на агенцията;
- 6. назначава и освобождава държавните служители в агенцията;
- 7. сключва, изменя и прекратява трудовите договори на служителите в агенцията;
- 8. осигурява условия за повишаване на професионалната квалификация на служителите в агенцията;
- 9.(изм. - ДВ, бр. 33 от 2019 г., в сила от 19.04.2019 г.) ръководи процеса по оценяване изпълнението на служителите в агенцията;
- 10.(отм. - ДВ, бр. 92 от 2011 г., нова - ДВ, бр. 33 от 2019 г., в сила от 19.04.2019 г.) дава указания или предложения за последващи мерки по чл. 18 - 20 от ЗДФИ;
- 11.(отм. - ДВ, бр. 92 от 2011 г.)
- 12. представя на министъра на финансите ежегоден отчет за резултатите от дейността на агенцията;
- 13. изпълнява и други функции, произтичащи от разпоредбите на ЗДФИ и правилника за прилагането му, както и възложени му с друг закон или нормативен акт.
(4) Правомощията на директора на агенцията при негово отсъствие или когато ползва законоустановен отпуск, се осъществяват от заместник-директора или от друг овластен служител на ръководна длъжност въз основа на писмена заповед за всеки отделен случай.
(5)(Изм. - ДВ, бр. 30 от 2009 г., изм. - ДВ, бр. 92 от 2011 г., изм. - ДВ, бр. 33 от 2019 г., в сила от 19.04.2019 г.) Директорът на агенцията може да възлага с писмена заповед на длъжностни лица изпълнението на отделни свои правомощия, когато това е предвидено в ЗДФИ или в друг нормативен акт.