(1) Специализираната администрация подпомага председателя при осъществяване на правомощията и отговорностите му по Закона за Националния архивен фонд.
(2)(Изм. - ДВ, бр. 8 от 2012 г., в сила от 27.01.2012 г.) Специализираната администрация е организирана във:
- 1. Главна дирекция "Архивна политика" с шест дирекции "Регионален държавен архив";
- 2. дирекция "Публичност на архивите";
- 3. дирекция "Дигитализация, реставрация, консервация и микрофилмиране";
- 4. дирекция "Централен държавен архив";
- 5. дирекция "Държавен военноисторически архив".
(3)(Нова - ДВ, бр. 8 от 2012 г., в сила от 27.01.2012 г.) Дейността на дирекциите "Централен държавен архив" (ЦДА), "Държавен военноисторически архив" (ДВИА) и "Регионален държавен архив" (РДА) се регламентира с правилници за устройството и дейността им, утвърдени от председателя на агенцията.