(1) Главният секретар организира, координира и контролира административните звена в Агенцията.
(2) Главният секретар е лице с професионален опит в областта на здравеопазването – седем години.
(3) Главният секретар осъществява административното ръководство на Агенцията, като:
- 1. осигурява организационната връзка между изпълнителния директор и административните звена;
- 2. организира разпределението на задачите между административните звена и осъществява общ контрол по изпълнението им;
- 3. утвърждава длъжностните характеристики на служителите в администрацията;
- 4. координира и контролира дейността по стопанисването и управлението на държавната собственост, предоставена на Агенцията;
- 5. упражнява контрол върху документооборота и съхраняването на документите в архива на Агенцията;
- 6. организира и ръководи информационното осигуряване;
- 7. организира и ръководи процеса на взаимодействие и координация с органите на изпълнителната власт;
- 8. организира работата с предложения и сигнали по реда на глава осма от Административнопроцесуалния кодекс;
- 9. организира, координира и контролира изготвянето на годишния доклад за състоянието на Агенцията;
- 10. ръководи, организира и контролира представителството на Агенцията пред трети лица и процесуалното представителство пред Комисията за защита на конкуренцията, Комисията за защита от дискриминация и всички съдебни инстанции в страната;
- 11. организира защитата на интересите на Агенцията при неизпълнение на сключени договори, включително чрез предприемане на съответните действия по съдебен ред;
- 12. дава становища за законосъобразността и съгласува проектите на договори и вътрешноведомствените актове;
- 13. ръководи, координира и контролира функционирането на общата и специализираната администрация за точното спазване на нормативните актове и на законните разпореждания на изпълнителния директор;
- 14. отговаря за планирането и отчетността при изпълнение на ежегодните цели на администрацията;
- 15. осъществява и други дейности, възложени от изпълнителния директор.