(1) Административното ръководство на Фонда се осъществява от главен секретар, който се назначава от изпълнителния директор.
(2) Главният секретар ръководи, координира и контролира функционирането и дейността на администрацията, като:
- 1. координира и контролира административните звена за точното спазване на нормативните актове извън областите на компетентност, определени със заповеди по чл. 11, ал. 1 и 2, както и с разпореждания на изпълнителния директор;
- 2. осигурява организационната връзка между изпълнителния директор и административните структури на Фонда, както и между самите структури;
- 3. осъществява взаимодействие с главния секретар на Министерския съвет и с главните секретари на другите министерства и администрации;
- 4. създава необходимите условия за разпределението на задачите между административните структури на Фонда съобразно утвърдените компетентности;
- 5. създава условия за нормална и ефективна работа на административните структури във Фонда;
- 6. координира и контролира дейността по стопанисването и управлението на предоставените и използваните от Фонда имоти и вещи;
- 7. координира и контролира дейностите по управление на човешките ресурси;
- 8. утвърждава длъжностните характеристики на служителите;
- 9. изпълнява и други функции, определени в нормативен акт или възложени му от изпълнителния директор.
(3) Главният секретар отговаря за изготвянето на ежегодния доклад за състоянието на администрацията.
(4) При отсъствие на главния секретар неговите функции се изпълняват от определено със заповед на изпълнителния директор длъжностно лице.