Дирекция "Финансова":
- 1. участва в процеса по управление на бюджетните средства на Фонда и следи за спазването на финансовата и бюджетната дисциплина;
- 2. разработва проект на бюджет и средносрочна бюджетна прогноза съгласно Единната бюджетна класификация и в програмен формат;
- 3. отговаря за съставянето, изпълнението и отчитането на бюджета на Фонда и сметката за средства от ЕС;
- 4. изготвя месечно разпределение на приходите, разходите, трансферите, бюджетното салдо и финансирането по бюджета и сметката за средства от Европейския съюз и заявки за ежемесечен лимит за плащане;
- 5. изготвя и отговаря за спазване на счетоводната политика и методологията на счетоводната отчетност на Фонда;
- 6. методически ръководи структурните звена на Фонда при изпълнение на задълженията им по финансово-счетоводната отчетност, свързани със средства, предоставяни от националния бюджет;
- 7. осчетоводява всички приходи, разходи и други операции, разплаща или прихваща при спазване на действащата нормативна уредба;
- 8. изготвя междинните финансови отчети и годишния финансов отчет, отчетите за касовото изпълнение на бюджета на Фонда и на сметката за средства от Европейския съюз;
- 9. изготвя и изпраща отчети за нуждите на ЕК относно извършените и прогнозните разходи и получените приходи по ЕФГЗ и ЕЗФРСР;
- 10. участва в подготовката и извършването на частичните и годишните инвентаризации на активите и пасивите на Фонда;
- 11. участва в процеса по администриране на нередности по ЕФГЗ и ЕЗФРСР, води регистър на установените от Разплащателната агенция нередности, докладва установените нередности съгласно приложимото законодателство;
- 12. инициира действия по принудително събиране и получава информация за събраните суми от Националната агенция за приходите (НАП);
- 13. изпълнява функции по Програма "САПАРД", като отговаря за процесите, свързани със сигнали за нередности, изискуеми задължения и други операции по програмата, както и опазване и съхраняване на оригиналната документация за проектите и вземанията.