(1)(Изм. - ДВ, бр. 54 от 1997 г.) Управлението и стопанисването на средствата по фонда се осъществяват от Управителен съвет с председател министъра на околната среда и водите.
(2)(Изм. - ДВ, бр. 72 от 1996 г., изм. - ДВ, бр. 81 от 1999 г., изм. - ДВ, бр. 64 от 2002 г.) Работата на Управителния съвет се подпомага от дирекция "Национален фонд за опазване на околната среда" на Министерството на околната среда и водите.
(3)(Изм. - ДВ, бр. 72 от 1996 г., отм. - ДВ, бр. 81 от 1999 г.)