(1) Специализираната администрация подпомага председателя на Агенцията при осъществяването на неговите функции и правомощия.
(2) Специализираната администрация е организирана във:
- 1. дирекция „Стратегии и политики за е-управление“ (СПЕУ);
- 2. дирекция „Бюджетен контрол и изпълнение на проекти“ (БКИП);
- 3. дирекция „Единен системен интегратор“ (ЕСИ);
- 4. дирекция „Електронна идентификация“ (ЕИ);
- 5. дирекция „Единен системен оператор“ (ЕСО);
- 6. дирекция „Мрежова и информационна сигурност“ (МИС);
- 7. Главна дирекция „Контрол, административнонаказателна дейност и експлоатация“ (ГД „КАНДЕ“).
(3) Дирекциите по ал. 2 могат да поддържат изнесени работни места, когато това е необходимо, с оглед на осъществяването на функциите им. Откриването и закриването на изнесените работни места се извършват от председателя на Агенцията по предложение на съответния директор на дирекция по ал. 2.