Управителният съвет утвърждава с решения:
- 1. вътрешни правила за работа в агенцията;
- 2. вътрешни правила за финансово управление и контрол в агенцията;
- 3. вътрешни правила за осъществяване на дейността по управление и контрол на проекти, финансирани със средства от Европейския съюз;
- 4. Етичен кодекс за поведение на служителите на агенцията.