Изключение за удължаване на срока се обосновава за повърхностни водни тела, когато:
- 1. изпълнението на мярката (мерките), чрез която се цели постигане на добро състояние, е свързана със строителство и отделните етапи на подготовка и изграждане на съответното съоръжение биха продължили по-дълго от 6 години (например изграждане на пречиствателна станция за отпадъчни води от населени места, пречиствателни съоръжения за индустриални отпадъчни води за големи обекти);
- 2. замърсяването на водните тела се дължи на неидентифициран източник (стари замърсявания, нефункциониращи рудници, нерегламентирани сметища и др.) и са необходими предварителни проучвания и картиране на източниците, преди да се предприемат съответните мерки;
- 3. са необходими детайлни мониторингови изследвания на седименти и биота за установяване на причините за лошото състояние преди предприемане на действия за решаване на проблема;
- 4. е необходимо възстановяване на естествени хабитати и дейностите (мерките) са свързани със залесяване, възстановяване на влажни зони, меандри и други дейности, за които е необходимо технологично време за възстановяване на водните съобщества/екосистеми.